MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Saprospira grandis str. Lewin chromosome

Total Repeats: 78235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016940	T	6	6	133	138	0 %	100 %	0 %	0 %	379728135
2	NC_016940	TAG	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728135
3	NC_016940	TAAA	2	8	222	229	75 %	25 %	0 %	0 %	379728135
4	NC_016940	AGG	2	6	237	242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379728135
5	NC_016940	CTT	2	6	328	333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728135
6	NC_016940	GGC	2	6	376	381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728135
7	NC_016940	GAA	2	6	401	406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728135
8	NC_016940	ACA	2	6	427	432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728135
9	NC_016940	A	6	6	434	439	100 %	0 %	0 %	0 %	379728135
10	NC_016940	ACA	2	6	496	501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728135
11	NC_016940	AGA	2	6	509	514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728135
12	NC_016940	A	6	6	596	601	100 %	0 %	0 %	0 %	379728135
13	NC_016940	CTG	2	6	678	683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728135
14	NC_016940	TGA	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728135
15	NC_016940	GGT	2	6	814	819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728135
16	NC_016940	ACT	2	6	897	902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728135
17	NC_016940	GAT	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728135
18	NC_016940	AAG	2	6	950	955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728135
19	NC_016940	TTTC	2	8	973	980	0 %	75 %	0 %	25 %	379728135
20	NC_016940	ATC	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728135
21	NC_016940	CT	3	6	1094	1099	0 %	50 %	0 %	50 %	379728135
22	NC_016940	CAA	2	6	1145	1150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728135
23	NC_016940	ATG	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728135
24	NC_016940	GAT	2	6	1328	1333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728135
25	NC_016940	ACT	2	6	1380	1385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728135
26	NC_016940	CT	3	6	1451	1456	0 %	50 %	0 %	50 %	379728135
27	NC_016940	TAA	2	6	1480	1485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728135
28	NC_016940	GCC	2	6	1505	1510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728135
29	NC_016940	TGG	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728135
30	NC_016940	AGA	2	6	1614	1619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728135
31	NC_016940	GCA	2	6	1994	1999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728136
32	NC_016940	CAT	2	6	2010	2015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728136
33	NC_016940	TCCA	2	8	2036	2043	25 %	25 %	0 %	50 %	379728136
34	NC_016940	CA	3	6	2056	2061	50 %	0 %	0 %	50 %	379728136
35	NC_016940	CCT	2	6	2067	2072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379728136
36	NC_016940	CGG	2	6	2091	2096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728136
37	NC_016940	TTC	2	6	2191	2196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728136
38	NC_016940	GGT	2	6	2244	2249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728136
39	NC_016940	CCA	2	6	2319	2324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379728136
40	NC_016940	CTT	2	6	2473	2478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728136
41	NC_016940	CGT	2	6	2557	2562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728136
42	NC_016940	GGT	2	6	2563	2568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728136
43	NC_016940	AAT	2	6	2580	2585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728136
44	NC_016940	TC	3	6	2673	2678	0 %	50 %	0 %	50 %	379728136
45	NC_016940	GCC	2	6	2759	2764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728136
46	NC_016940	CTT	2	6	2793	2798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728136
47	NC_016940	A	6	6	2808	2813	100 %	0 %	0 %	0 %	379728136
48	NC_016940	GCC	2	6	3040	3045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728136
49	NC_016940	ATA	2	6	3046	3051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728136
50	NC_016940	TTA	2	6	3080	3085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728136
51	NC_016940	GCT	2	6	3114	3119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728136
52	NC_016940	CTG	2	6	3160	3165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728136
53	NC_016940	CTC	2	6	3175	3180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379728136
54	NC_016940	GTTT	2	8	3248	3255	0 %	75 %	25 %	0 %	379728137
55	NC_016940	CT	3	6	3263	3268	0 %	50 %	0 %	50 %	379728137
56	NC_016940	T	9	9	3328	3336	0 %	100 %	0 %	0 %	379728137
57	NC_016940	TGG	2	6	3513	3518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728138
58	NC_016940	ATT	2	6	3549	3554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728138
59	NC_016940	ATT	2	6	3590	3595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728138
60	NC_016940	A	8	8	3621	3628	100 %	0 %	0 %	0 %	379728138
61	NC_016940	GTC	2	6	3716	3721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728138
62	NC_016940	CCT	2	6	3731	3736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379728138
63	NC_016940	CAT	2	6	3746	3751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728138
64	NC_016940	GAAA	2	8	3817	3824	75 %	0 %	25 %	0 %	379728138
65	NC_016940	CTTT	2	8	3947	3954	0 %	75 %	0 %	25 %	379728138
66	NC_016940	GCC	2	6	3962	3967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728138
67	NC_016940	CGA	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728138
68	NC_016940	GAT	2	6	4295	4300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728138
69	NC_016940	TGCC	2	8	4359	4366	0 %	25 %	25 %	50 %	379728138
70	NC_016940	ATG	2	6	4371	4376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728138
71	NC_016940	CAA	2	6	4379	4384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728138
72	NC_016940	TTC	2	6	4415	4420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728138
73	NC_016940	AGA	2	6	4426	4431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
74	NC_016940	GAA	2	6	4475	4480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
75	NC_016940	A	6	6	4538	4543	100 %	0 %	0 %	0 %	379728138
76	NC_016940	GAA	2	6	4559	4564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
77	NC_016940	ATTT	2	8	4591	4598	25 %	75 %	0 %	0 %	379728138
78	NC_016940	CGC	2	6	4625	4630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728138
79	NC_016940	AGA	2	6	4742	4747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
80	NC_016940	GAA	2	6	4769	4774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
81	NC_016940	GGT	2	6	4813	4818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728138
82	NC_016940	GAA	2	6	4823	4828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
83	NC_016940	AGA	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
84	NC_016940	AAT	2	6	4848	4853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728138
85	NC_016940	CAT	2	6	5119	5124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728139
86	NC_016940	A	6	6	5217	5222	100 %	0 %	0 %	0 %	379728139
87	NC_016940	ATT	2	6	5252	5257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728139
88	NC_016940	CCA	2	6	5319	5324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379728139
89	NC_016940	ATT	2	6	5355	5360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728139
90	NC_016940	ATT	2	6	5410	5415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728139
91	NC_016940	CCG	2	6	5434	5439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728139
92	NC_016940	AAG	3	9	5532	5540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728139
93	NC_016940	GAAAT	2	10	5579	5588	60 %	20 %	20 %	0 %	379728139
94	NC_016940	AAG	2	6	5598	5603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728139
95	NC_016940	GCTTT	2	10	5662	5671	0 %	60 %	20 %	20 %	379728139
96	NC_016940	TTGCGC	2	12	5774	5785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728139
97	NC_016940	AAG	2	6	5802	5807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728139
98	NC_016940	AAG	2	6	5832	5837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728139
99	NC_016940	ATT	2	6	5876	5881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728139
100	NC_016940	AAG	2	6	5886	5891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728139
101	NC_016940	T	6	6	5896	5901	0 %	100 %	0 %	0 %	379728139
102	NC_016940	ACT	2	6	5920	5925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728139
103	NC_016940	ATT	2	6	6015	6020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728139
104	NC_016940	GCA	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728139
105	NC_016940	TGC	2	6	6076	6081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728139
106	NC_016940	TCA	2	6	6144	6149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728139
107	NC_016940	CGG	3	9	6199	6207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728139
108	NC_016940	CTGG	2	8	6235	6242	0 %	25 %	50 %	25 %	379728139
109	NC_016940	AAT	2	6	6290	6295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728139
110	NC_016940	CGA	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728140
111	NC_016940	CGA	2	6	6639	6644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728140
112	NC_016940	CCG	2	6	6658	6663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728140
113	NC_016940	TGC	2	6	6670	6675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728140
114	NC_016940	T	7	7	6715	6721	0 %	100 %	0 %	0 %	379728140
115	NC_016940	CAT	2	6	7018	7023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728141
116	NC_016940	GCA	2	6	7048	7053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728141
117	NC_016940	GTT	2	6	7063	7068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379728141
118	NC_016940	TA	3	6	7091	7096	50 %	50 %	0 %	0 %	379728141
119	NC_016940	TA	4	8	7103	7110	50 %	50 %	0 %	0 %	379728141
120	NC_016940	TTC	2	6	7127	7132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728141
121	NC_016940	ATA	2	6	7184	7189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728141
122	NC_016940	CGG	2	6	7219	7224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728141
123	NC_016940	TCA	2	6	7254	7259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728141
124	NC_016940	GTT	2	6	7386	7391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379728141
125	NC_016940	TAA	2	6	7403	7408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728141
126	NC_016940	TGC	2	6	7434	7439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728141
127	NC_016940	TGC	2	6	7560	7565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728141
128	NC_016940	CTG	2	6	7568	7573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728141
129	NC_016940	TCAA	2	8	7626	7633	50 %	25 %	0 %	25 %	379728141
130	NC_016940	TGC	2	6	7709	7714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728141
131	NC_016940	TAA	2	6	7719	7724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728141
132	NC_016940	CTA	2	6	7758	7763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728141
133	NC_016940	GGC	2	6	7794	7799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728141
134	NC_016940	CTTT	2	8	7865	7872	0 %	75 %	0 %	25 %	379728141
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396	NC_016940	GGA	2	6	19474	19479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379728157
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402	NC_016940	TTG	2	6	19758	19763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379728158
403	NC_016940	GC	3	6	19776	19781	0 %	0 %	50 %	50 %	379728158
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446	NC_016940	CATC	2	8	22280	22287	25 %	25 %	0 %	50 %	379728159
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